Стаття присвячена вивченню необхідності змін у роботі митних адміністрацій, що викликано пандемією, що зруйнувала або значно пошкодила наявні ланцюги постачання у всьому світі. Для протидії цьому митні адміністрації повинні реалізовувати скоординований та проактивний підхід з усіма зацікавленими відомствами для сприяння міжнародній торгівлі. Основною метою статті є дослідження трансформації здійснення державної митної справи в контексті антикризового реагування на умови пандемії COVID-19. Методологія дослідження базується на таких загальнонаукових методах дослідження як: аналіз і синтез, систематизація та узагальнення. Визначено основні напрями реінжинірингу роботи митних органів, які мають безперервно працювати й в умовах часових обмежень; організаційний дизайн реагування; протиепідемічний захист посадових осіб; цифровізацію здійснення митних процедур; митне регулювання; заходи сприяння торгівлі. Зокрема, відзначено, що в кризових умовах актуальним завданням є формування оперативних груп антикризового реагування, як це було запроваджено Китаєм. У статті наведені основні обов’язки таких оперативних груп та акцентовано увагу на необхідності швидкого внесення змін у законодавство та проведення консультацій із зацікавленими особами. Визначені основні заходи щодо забезпечення безпеки персоналу, які мають бути сформовано митними адміністраціями у тісній співпраці з органами охорони здоров'я та іншими зацікавленими сторонами. Також визначено заходи сприяння торгівлі, зокрема шляхом збору даних та їх представлення у репозитарії Світової організації торгівлі. Результати дослідження можуть бути використані з метою вивчення та удосконалення напрямів реформування митної системи України.